En enero de 1990 el entonces consejero de Salud del Gobierno de Navarra, Carlos Artundo, anunciaba en un encuentro con representantes de la Cendea de Cizur la construcción de un nuevo centro de salud capaz de atender a una población que, principalmente debido a la nueva urbanización de Zizur Mayor, iba en aumento. Dos años más tarde el también entonces presidente del concejo y alcalde de la cendea, Luis Ibero, recién constituido Zizur Mayor como municipio desligado de la Cendea de Cizur, lamentaba el escaso eco que sus peticiones tenían en el Gobierno de Navarra y citaba concretamente que mientras Mendillorri, sin apenas vecinos, nacía con un centro de salud, Zizur Mayor carecía de él. Unos meses después de estas declaraciones, en diciembre de 1992, comenzaban las obras del nuevo centro que iba a atender a una población de 6.500 vecinos y que estaría en marcha en el otoño de 1993, aunque finalmente se inauguró el 31 de mayo de 1994.

La parcela, cedida por el consistorio al gobierno tenía una superficie de casi 1.500 metros cuadrados y estaba situada junto al parque Erreniega. El edificio había sido diseñado por los arquitectos Sigifredo Martín y Maite Apesteguía.

Hasta la inauguración el centro de atención primaria estaba ubicado en la antigua casa del médico de la avenida Belascoáin, en unos locales obsoletos e insuficientes para la población que atendía. El presupuesto de las obras, inicialmente de 160 millones de pesas, ascendió finalmente a los 201 millones.