Un estudio revela interacciones genéticas entre el huésped y el virus a nivel genómico en el riesgo de cáncer

Un estudio de la Escuela de Salud Pública Mailman de la Universidad de Columbia (Estados Unidos) informa de un importante avance en la comprensión de cómo las interacciones entre los genomas humanos y virales influyen en el riesgo de padecer enfermedades.

La investigación descubrió que las variaciones en el virus de Epstein-Barr (VEB), junto con un gen específico relacionado con el sistema inmunitario (HLA-A 11:01), influyen notablemente en el riesgo de cáncer nasofaríngeo. Los hallazgos se publican en la revista 'Nature'.

Este estudio ofrece un análisis genómico a gran escala de las interacciones huésped-virus en el riesgo de cáncer. El estudio fue codirigido por Zhonghua Liu, doctor en Ciencias, profesor adjunto de Bioestadística en la Escuela Mailman de la Universidad de Columbia y coautor principal, quien lideró el diseño y el análisis estadístico.

Aunque el VEB infecta a más del 95 por ciento de los adultos en todo el mundo, solo una pequeña fracción desarrolla cánceres asociados al VEB, por lo que resulta fundamental comprender cómo los factores del huésped y del virus influyen conjuntamente en el riesgo de padecer la enfermedad.

En lugar de analizar la variación genética humana o viral por separado, los investigadores examinaron conjuntamente los datos de asociación del genoma humano junto con la secuenciación del genoma completo del VEB, lo que permitió una búsqueda sistemática de interacciones genéticas en ambos genomas.

Mediante este enfoque, el equipo identificó una interacción clave entre el alelo HLA humano HLA-A 11:01 y una variante viral (SNP 85841G) en el gen EBNA3B del VEB. Los resultados demuestran que el riesgo de cáncer no depende únicamente de la genética del huésped ni de la cepa viral, sino de sus efectos combinados. Las personas con antecedentes genéticos susceptibles de HLA infectadas con cepas de VEB de alto riesgo portadoras de la variante 85841G se enfrentan a un riesgo considerablemente mayor.

"La mayoría de los estudios genéticos examinan el genoma del huésped o el genoma del patógeno por separado. Al analizar ambos genomas juntos utilizando métodos avanzados de genética estadística y marcos de interacción inspirados en la inferencia causal, podemos identificar y cuantificar interacciones genéticas que de otro modo permanecerían ocultas", asegura el doctor Liu, quien también dirige el Laboratorio de Genómica Causal en Columbia.

El estudio empleó un marco analítico por etapas que integraba la genética estadística con métodos de inferencia causal para detectar y cuantificar las interacciones huésped-virus en todo el genoma. El enfoque controló la estructura poblacional tanto en el genoma humano como en el viral, así como la relación entre las muestras y las pruebas múltiples.

Más allá de las asociaciones estadísticas, los experimentos funcionales demostraron que la mutación viral produce un péptido que puede ser presentado por HLA-A 11:01, lo que desencadena respuestas de células T CD8+ restringidas por HLA-A 11:01 que pueden eliminar las células B transformadas por el VEB que portan cepas 85841G.

En general, el estudio subraya el papel cada vez más importante de la genómica estadística y la inferencia causal en los descubrimientos biomédicos modernos, especialmente a medida que los investigadores integran múltiples sistemas genómicos para comprender mejor las enfermedades complejas. DOI: 10.1038/s41586-026-10416-8